锰主要有三方面的作用：
(1)促进光合作用 近年来初步证明锰参与叶绿体的结构，约200个叶绿体分子中有3—4个锰原子；锰是水光解的催化剂，反应大至如下：
光
2H2O────────────→O2↑+4H++4e(电子)
Cl.Mn-叶绿体
放出的电子和氢离子参与和二氧化碳合成碳水化合物。
(2)锰是许多酶的活化剂 如柠檬酸脱氢酶、苹果酸脱氢酶、核糖核酸聚合酶、精氨酸酶等到都需要锰做活化剂，所以锰与碳素代谢、氮素代谢都有关系。
(3)有调节氧化还原电位的作用 主要是锰本身是个变价离子，有2价、3价和4价。
锰有促进种子发芽幼茼生长、加速花粉萌发和花粉管伸长的作用。如根据罗宗洛等到人试验，用浓度为每升水中含有1—50毫克的锰的溶液浸种能促进种子萌发、幼苗生长；我们用0.01%硫酸锰浸黄瓜种，结果出芽整齐，根粗且长。
作物缺锰叶片的主脉和侧脉附近为深绿色，呈带状，叶脉间为浅绿色，这种失绿症一般出现在新的枝条上；严重缺锰时叶脉间的失绿区域变成灰绿到灰白色，叶片薄，枝条有顶枯现象。禾本科作物缺锰则出现与叶脉平行为失绿条纹(浅绿色)，以后逐渐变成灰绿色、灰白色或褐红色。
作物缺锰时一般可喷施0.05—0.1%硫酸锰溶液。
